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    AI發(fā)現(xiàn)冠心病罕見變異基因
    2024-06-20 11:05:04   來源:科技日報(bào)

    美國西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院研究人員使用一種先進(jìn)的人工智能(AI)工具,在17個(gè)基因中識(shí)別出罕見的編碼變異,揭示了冠狀動(dòng)脈疾病(CAD,也稱冠心病)的分子基礎(chǔ)。近日發(fā)表在《自然·遺傳學(xué)》上的相關(guān)研究,揭示了影響心臟病的遺傳因素,或?yàn)樾难芗膊〉亩ㄏ蛑委熀蛡€(gè)性化治療開辟新途徑。


    研究人員使用外顯子組測序數(shù)據(jù)對基于機(jī)器學(xué)習(xí)的CAD標(biāo)記物進(jìn)行了一項(xiàng)罕見變異關(guān)聯(lián)研究,確定了17個(gè)基因中的罕見編碼變異,揭示了CAD的分子基礎(chǔ)。

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    圖片來源:美國西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院

    研究人員使用一種計(jì)算機(jī)生成的冠狀動(dòng)脈疾病評分(ISCAD)來全面分析冠心病。ISCAD評分結(jié)合了電子健康記錄中數(shù)百種不同臨床特征,包括生命體征、實(shí)驗(yàn)室測試結(jié)果、藥物、癥狀和診斷。為了建立AI評分系統(tǒng),他們在這項(xiàng)綜合分析中,利用英國生物庫、“我們所有人”研究計(jì)劃和BioMe生物銀行中604914人的電子健康記錄對系統(tǒng)進(jìn)行了機(jī)器學(xué)習(xí)訓(xùn)練。

    隨后,研究人員測試了該評分與這些個(gè)體外顯子組序列中發(fā)現(xiàn)的罕見和超罕見編碼變異的關(guān)聯(lián)性。此外,團(tuán)隊(duì)還進(jìn)一步研究了所發(fā)現(xiàn)的基因在CAD的致病危險(xiǎn)因素、CAD的臨床表現(xiàn)及其與CAD狀態(tài)之間的聯(lián)系等方面的作用。

    AI工具最終在17個(gè)基因中識(shí)別出編碼變異,并幫助研究人員了解這些基因是如何與冠狀動(dòng)脈疾病產(chǎn)生關(guān)聯(lián)的。由于它們只發(fā)生在一小部分個(gè)體中,罕見編碼變異的存在可能對疾病風(fēng)險(xiǎn)或易感性產(chǎn)生重大影響。因此,研究這些變異有望為確定心臟病的生理機(jī)制和發(fā)現(xiàn)治療的基因靶點(diǎn)提供新途徑。


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